「思い出して、翅（はね）があったころのことを」　　1萬2千年前の想いに応え、繋がったのは欠けたこころ。　　太陽と月と火星が出會うとき、新たな合體の調べが流れる──！　　湘南の海に浮かぶ小島、江の島。　　美しくのどかなその浜辺に、〈私立江ノ島學園〉はある。　　學園には、全國から優秀な子どもが集められ、　　最新の機器を使った英才教育が施されていた?！　√厥鈴娀楗工紊健触ē欹幞螗取丹诉xばれたサッコ、リミヤ、トシは、　　感情の力で動く戦闘機〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、　　謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる?！　椁い韦丹胜⒉豢伤甲hなヴィジョンに導かれ、サッコは叫ぶ──?！　　赶胄呛象w！　GO、アクエリオン！」　　繰り返される輪廻の果てに、現れた機械天翅アクエリオン?！　∷廾虮池摛盲可倌晟倥稀ⅰ　〉皿wのしれない団體〈宇宙たまごの會〉や大人たちの思惑が交錯す...