《神探狄仁杰2》由《關河疑影》、《蛇靈》和《血色江州》三個撲朔迷離、驚險離奇的故事組成。《關河疑影》發生在武周年間。契丹犯境，烽煙迭起。武則天（呂中飾）任命狄仁杰（梁冠華飾）為河北道行軍大總管，調查邊情戰事失敗原因。《蛇靈》講述蛇靈逆黨興風作浪再起波瀾，一場刺殺與保衛的 激烈較量由此拉開戰幕。《血色江州》講述江州血案不斷發生，狄仁杰與護衛李元芳（張子健飾）如何樹藤摸瓜，挖出真正為害人民的惡魔【mó】的故事。