十多年前一只擁有巨大威力的妖獸“九尾妖狐”襲擊了木葉忍者村，當時的第四代火影拼盡全力，以自己的生命為代價將“九尾妖狐”封印在了剛出生的鳴人身上。木葉村終于恢復了平靜，但村民們卻把鳴人當成像“九尾妖狐”那樣的怪物看待，所有人都疏遠他。鳴人自小就孤苦無依，一晃十多年過去了，少年鳴人考入了木葉村的忍者學?！緓iào】，結識了好朋友佐助和小櫻。佐助是宇智波家族的傳人之一，當他還是小孩的時候他的哥哥——一個已經擁有高超忍術的忍者將他們家族的人都殺死了，然后投靠了一直想將木葉村毀滅的大蛇丸，佐助自小就發誓要超越哥哥，為家族報仇。鳴人他們在忍者學校得到了教官卡卡西的精心指點，在他的幫助下去迎接成長中的一次又一次挑戰！